Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. MPlayer ondersteunt minimaal 46 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die MPlayer ondersteunt zijn .MKV. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in MPlayer op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door MPlayer.
MPlayer kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via MPlayer en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door MPlayer.