Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. SWF & FLV Toolbox ondersteunt minimaal 6 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die SWF & FLV Toolbox ondersteunt zijn .SWF. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in SWF & FLV Toolbox op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door SWF & FLV Toolbox.
SWF & FLV Toolbox kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via SWF & FLV Toolbox en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door SWF & FLV Toolbox.