Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. QuickBooks ondersteunt minimaal 39 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die QuickBooks ondersteunt zijn .CSV. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in QuickBooks op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door QuickBooks.
QuickBooks kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via QuickBooks en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door QuickBooks.