Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. Pegasus Mail ondersteunt minimaal 32 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die Pegasus Mail ondersteunt zijn .DAT. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in Pegasus Mail op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door Pegasus Mail.
Pegasus Mail kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via Pegasus Mail en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door Pegasus Mail.