Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. Navicat Premium (Linux) ondersteunt minimaal 33 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die Navicat Premium (Linux) ondersteunt zijn .SQL. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in Navicat Premium (Linux) op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door Navicat Premium (Linux).
Navicat Premium (Linux) kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via Navicat Premium (Linux) en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door Navicat Premium (Linux).