Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. Call of Duty ondersteunt minimaal 8 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die Call of Duty ondersteunt zijn .PK3. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in Call of Duty op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door Call of Duty.
Call of Duty kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via Call of Duty en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door Call of Duty.