Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. Xenon ondersteunt minimaal 1 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die Xenon ondersteunt zijn .C6. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in Xenon op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door Xenon.
Xenon kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via Xenon en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door Xenon.