Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. XenCenter ondersteunt minimaal 3 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die XenCenter ondersteunt zijn .XVA. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in XenCenter op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door XenCenter.
XenCenter kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via XenCenter en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door XenCenter.