Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. WorshipCenter Pro ondersteunt minimaal 1 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die WorshipCenter Pro ondersteunt zijn .MLA. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in WorshipCenter Pro op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door WorshipCenter Pro.
WorshipCenter Pro kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via WorshipCenter Pro en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door WorshipCenter Pro.