Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. WinOnCD Media Suite ondersteunt minimaal 1 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die WinOnCD Media Suite ondersteunt zijn .C2D. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in WinOnCD Media Suite op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door WinOnCD Media Suite.
WinOnCD Media Suite kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via WinOnCD Media Suite en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door WinOnCD Media Suite.