Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. Web CEO ondersteunt minimaal 1 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die Web CEO ondersteunt zijn .WKP. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in Web CEO op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door Web CEO.
Web CEO kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via Web CEO en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door Web CEO.