Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. UltimateZip ondersteunt minimaal 1 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die UltimateZip ondersteunt zijn .UZE. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in UltimateZip op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door UltimateZip.
UltimateZip kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via UltimateZip en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door UltimateZip.