Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. Uconomix Encryption Engine ondersteunt minimaal 1 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die Uconomix Encryption Engine ondersteunt zijn .UEED. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in Uconomix Encryption Engine op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door Uconomix Encryption Engine.
Uconomix Encryption Engine kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via Uconomix Encryption Engine en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door Uconomix Encryption Engine.