Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. TurboProject ondersteunt minimaal 1 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die TurboProject ondersteunt zijn .PEP. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in TurboProject op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door TurboProject.
TurboProject kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via TurboProject en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door TurboProject.