Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. Tropico 4 ondersteunt minimaal 1 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die Tropico 4 ondersteunt zijn .HPK. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in Tropico 4 op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door Tropico 4.
Tropico 4 kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via Tropico 4 en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door Tropico 4.