Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. TombRaider ondersteunt minimaal 1 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die TombRaider ondersteunt zijn .TR3. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in TombRaider op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door TombRaider.
TombRaider kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via TombRaider en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door TombRaider.