Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. The Complete Animator ondersteunt minimaal 1 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die The Complete Animator ondersteunt zijn .TCA. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in The Complete Animator op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door The Complete Animator.
The Complete Animator kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via The Complete Animator en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door The Complete Animator.