Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. TeXworks ondersteunt minimaal 10 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die TeXworks ondersteunt zijn .STY. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in TeXworks op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door TeXworks.
TeXworks kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via TeXworks en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door TeXworks.