Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. TARGET 3001! ondersteunt minimaal 1 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die TARGET 3001! ondersteunt zijn .T3001. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in TARGET 3001! op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door TARGET 3001!.
TARGET 3001! kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via TARGET 3001! en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door TARGET 3001!.