Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. Sword of the Stars ondersteunt minimaal 1 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die Sword of the Stars ondersteunt zijn .SHIPSECTION. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in Sword of the Stars op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door Sword of the Stars.
Sword of the Stars kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via Sword of the Stars en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door Sword of the Stars.