Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. Submarine Titans ondersteunt minimaal 1 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die Submarine Titans ondersteunt zijn .DKD. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in Submarine Titans op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door Submarine Titans.
Submarine Titans kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via Submarine Titans en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door Submarine Titans.