Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. Soldier of Fortune II ondersteunt minimaal 1 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die Soldier of Fortune II ondersteunt zijn .WNT. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in Soldier of Fortune II op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door Soldier of Fortune II.
Soldier of Fortune II kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via Soldier of Fortune II en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door Soldier of Fortune II.