Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. Sokoban++ ondersteunt minimaal 1 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die Sokoban++ ondersteunt zijn .G4B. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in Sokoban++ op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door Sokoban++.
Sokoban++ kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via Sokoban++ en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door Sokoban++.