Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. SkyMap ondersteunt minimaal 1 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die SkyMap ondersteunt zijn .TGL. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in SkyMap op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door SkyMap.
SkyMap kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via SkyMap en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door SkyMap.