Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. SEO SpyGlass ondersteunt minimaal 1 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die SEO SpyGlass ondersteunt zijn .SPY. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in SEO SpyGlass op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door SEO SpyGlass.
SEO SpyGlass kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via SEO SpyGlass en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door SEO SpyGlass.