Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. SDDS Toolkit ondersteunt minimaal 1 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die SDDS Toolkit ondersteunt zijn .TWI. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in SDDS Toolkit op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door SDDS Toolkit.
SDDS Toolkit kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via SDDS Toolkit en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door SDDS Toolkit.