Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. Route 66 ondersteunt minimaal 2 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die Route 66 ondersteunt zijn .LMX. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in Route 66 op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door Route 66.
Route 66 kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via Route 66 en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door Route 66.