Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. Return to Castle Wolfenstein: Enemy Territory ondersteunt minimaal 5 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die Return to Castle Wolfenstein: Enemy Territory ondersteunt zijn .PK3. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in Return to Castle Wolfenstein: Enemy Territory op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door Return to Castle Wolfenstein: Enemy Territory.
Return to Castle Wolfenstein: Enemy Territory kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via Return to Castle Wolfenstein: Enemy Territory en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door Return to Castle Wolfenstein: Enemy Territory.