Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. Return to Castle Wolfenstein ondersteunt minimaal 3 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die Return to Castle Wolfenstein ondersteunt zijn .PK3. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in Return to Castle Wolfenstein op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door Return to Castle Wolfenstein.
Return to Castle Wolfenstein kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via Return to Castle Wolfenstein en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door Return to Castle Wolfenstein.