Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. Rational XDE ondersteunt minimaal 9 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die Rational XDE ondersteunt zijn .SMX. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in Rational XDE op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door Rational XDE.
Rational XDE kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via Rational XDE en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door Rational XDE.