Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. PowerISO ondersteunt minimaal 20 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die PowerISO ondersteunt zijn .BIN. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in PowerISO op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door PowerISO.
PowerISO kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via PowerISO en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door PowerISO.