Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. Plex Media Center for OS X ondersteunt minimaal 3 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die Plex Media Center for OS X ondersteunt zijn .MKV. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in Plex Media Center for OS X op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door Plex Media Center for OS X.
Plex Media Center for OS X kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via Plex Media Center for OS X en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door Plex Media Center for OS X.