Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. Pika Software Builder ondersteunt minimaal 1 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die Pika Software Builder ondersteunt zijn .PIKA. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in Pika Software Builder op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door Pika Software Builder.
Pika Software Builder kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via Pika Software Builder en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door Pika Software Builder.