Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. PI Expert Suite ondersteunt minimaal 1 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die PI Expert Suite ondersteunt zijn .UDX. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in PI Expert Suite op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door PI Expert Suite.
PI Expert Suite kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via PI Expert Suite en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door PI Expert Suite.