Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. Photonic Professional ondersteunt minimaal 1 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die Photonic Professional ondersteunt zijn .GWL. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in Photonic Professional op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door Photonic Professional.
Photonic Professional kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via Photonic Professional en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door Photonic Professional.