Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. Phase One Capture One ondersteunt minimaal 7 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die Phase One Capture One ondersteunt zijn .COL. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in Phase One Capture One op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door Phase One Capture One.
Phase One Capture One kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via Phase One Capture One en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door Phase One Capture One.