Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. Perl Code Editor ondersteunt minimaal 4 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die Perl Code Editor ondersteunt zijn .PL. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in Perl Code Editor op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door Perl Code Editor.
Perl Code Editor kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via Perl Code Editor en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door Perl Code Editor.