Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. Perfect Icon ondersteunt minimaal 1 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die Perfect Icon ondersteunt zijn .ICON. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in Perfect Icon op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door Perfect Icon.
Perfect Icon kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via Perfect Icon en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door Perfect Icon.