Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. PDAStore Command (PDASCMD) ondersteunt minimaal 1 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die PDAStore Command (PDASCMD) ondersteunt zijn .PDAS. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in PDAStore Command (PDASCMD) op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door PDAStore Command (PDASCMD).
PDAStore Command (PDASCMD) kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via PDAStore Command (PDASCMD) en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door PDAStore Command (PDASCMD).