Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. PaintShop Pro ondersteunt minimaal 103 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die PaintShop Pro ondersteunt zijn .EMZ. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in PaintShop Pro op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door PaintShop Pro.
PaintShop Pro kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via PaintShop Pro en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door PaintShop Pro.