Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. NoteWorthy Composer ondersteunt minimaal 5 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die NoteWorthy Composer ondersteunt zijn .MID. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in NoteWorthy Composer op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door NoteWorthy Composer.
NoteWorthy Composer kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via NoteWorthy Composer en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door NoteWorthy Composer.