Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. Note-It ondersteunt minimaal 1 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die Note-It ondersteunt zijn .NOT. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in Note-It op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door Note-It.
Note-It kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via Note-It en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door Note-It.