Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. Nmap ondersteunt minimaal 1 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die Nmap ondersteunt zijn .NSE. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in Nmap op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door Nmap.
Nmap kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via Nmap en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door Nmap.