Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. NJStar ondersteunt minimaal 1 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die NJStar ondersteunt zijn .ZW. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in NJStar op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door NJStar.
NJStar kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via NJStar en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door NJStar.