Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. Nisus Writer Pro ondersteunt minimaal 4 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die Nisus Writer Pro ondersteunt zijn .NWCP. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in Nisus Writer Pro op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door Nisus Writer Pro.
Nisus Writer Pro kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via Nisus Writer Pro en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door Nisus Writer Pro.