Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. Naviextras Toolbox ondersteunt minimaal 1 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die Naviextras Toolbox ondersteunt zijn .UPOI. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in Naviextras Toolbox op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door Naviextras Toolbox.
Naviextras Toolbox kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via Naviextras Toolbox en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door Naviextras Toolbox.