Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. MultiLoader Downloader ondersteunt minimaal 1 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die MultiLoader Downloader ondersteunt zijn .RC1. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in MultiLoader Downloader op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door MultiLoader Downloader.
MultiLoader Downloader kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via MultiLoader Downloader en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door MultiLoader Downloader.