Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. MS-DOS ondersteunt minimaal 39 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die MS-DOS ondersteunt zijn .EXE. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in MS-DOS op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door MS-DOS.
MS-DOS kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via MS-DOS en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door MS-DOS.