Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. Mouse and Key Recorder ondersteunt minimaal 1 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die Mouse and Key Recorder ondersteunt zijn .KRC. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in Mouse and Key Recorder op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door Mouse and Key Recorder.
Mouse and Key Recorder kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via Mouse and Key Recorder en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door Mouse and Key Recorder.