Standaard ondersteunt alle software meerdere bestandsextensies. Modern Combat 2: Black Pegasus ondersteunt minimaal 1 verschillende bestandsextensies. De basisbestanden die Modern Combat 2: Black Pegasus ondersteunt zijn .BDAE. Niet alle extensies in de lijst worden echter altijd gebruikt om de effecten van werk in Modern Combat 2: Black Pegasus op te slaan. Heel vaak worden bestanden met dergelijke extensies gebruikt als brongegevensbestanden die worden gebruikt door Modern Combat 2: Black Pegasus.
Modern Combat 2: Black Pegasus kan worden gebruikt om bestandsformaten te converteren tussen de hieronder vermelde bestandsextensies. U kunt een bestand met een van de onderstaande bestandsextensies openen via Modern Combat 2: Black Pegasus en proberen het op te slaan in een ander bestandsformaat, ook ondersteund door Modern Combat 2: Black Pegasus.